Už od 14. storočia bolo mesto významných centrom obchodu s korením, na začiatku 16. storočia prešlo pod nadvládu Portugalska a stalo sa tak prvou európskou kolóniou v Indii. Neskôr Koči vládli Holanďania a až do doby, kým India v roku 1947 získala nezávislosť ju spravovali Briti. Dnes je finančným a priemyselným centrom oblasti a patrí medzi jedno z turisticky najnavštevovanejších miest v Indii. Toto je jedno z mála miest v Indii, kde väčšinu obyvateľov netvoria hinduisti.